W celu zapewnienia bezpiecznych warunków pracy pracowników w związku z przeładunkiem i składowaniem ładunków niebezpiecznych opracowano i wdrożono "Instrukcję bezpiecznej obsługi przeładunku i składowania ładunków niebezpiecznych i zanieczyszczających dla Euro Terminal Sp. z o.o. w Świnoujściu", która określa zasady działania i obowiązki pracowników terminalu, podstawowe zasady bezpieczeństwa obowiązujące w trakcie czynności przeładunkowych oraz procedury postępowania w sytuacji zagrożenia.